水警總區擁有一支超過100艘船的船隊，能夠應付不同行動及地理環境上的需要。以下為一些主要船隻的類型：
總區訓練警輪
總長度 : 40公尺
船員 : 7名
數量 : 1艘
分區指揮警輪
總長度 : 32.6公尺
船員 : 19名
數量 :6艘
分區巡邏警輪
總長度 : 30公尺
船員 : 14名
數量 :6艘
建造商 : 財利船廠
警察行動平台察行動平台
警察行動平台察行動平台
總長度 : 30M公尺
船員 : 4名
數量 :4艘
中型巡邏警輪
總長度 : 19公尺
船員 : 5名
數量 :17艘
近岸巡邏艇
總長度 : 13公尺
船員 : 4名
數量 : 6 艘
高速追截艇
總長度 : 14.8公尺
船員 : 5名
數量 : 4艘
分區高速巡邏艇
總長度 : 11公尺
船員 : 3名
數量 :21艘
90匹硬體小艇
總長度 : 5.4公尺
船員 : 2名
數量 : 10艘
180 匹小艇
總長度 : 6.4公尺
船員 : 2名
數量 : 6艘
23 匹小艇
總長度 : 4.9公尺
船員 : 2名
數量 : 2 艘
多重任務截擊艇
總長度 : 10.7公尺
船員 : 4名
數量 : 8艘
后海灣氣墊船
總長度 : 8.6公尺
船員 : 4名
數量 : 2 艘
后海灣高速小艇
總長度 : 8.6公尺
數量 : 10 艘
高速追截訓練艇
總長度 : 11.85公尺
船員 : 4名
數量 : 1 艘
