中國海警局南海分局執法部部長丁文剛於五月十四日至十六日率領六人代表團到訪水警總區，參觀水警總區指揮及控制中心、水警訓練學校及多個海上分區，深入了解水警總區採用的警政及訓練策略。訪問期間，水警總區指揮官吳卓衡與代表團舉行高層會議，就廣東海警局與水警總區的合作事宜簽訂協議。雙方現可按照三層機制進行定期溝通、專題會議、情報與資訊交流及聯合行動。

內地執法部門重組後，廣東海警局於二零一九年成立一個直屬分局，專責處理發生於香港特區上邊界管理線外的執法事宜。多年來，水警總區與廣東海警局依照香港警方與內地當局的邊境聯絡機制，共同打擊跨境非法活動。以二零二三年的非華裔人士偷渡潮為例，在廣東海警局聯同國家移民管理局、廣東省公安廳及香港警方的跨境協作下，短短數月內成功遏止經海路偷渡的趨勢。