中国海警局南海分局执法部部长丁文刚于五月十四日至十六日率领六人代表团到访水警总区，参观水警总区指挥及控制中心、水警训练学校及多个海上分区，深入了解水警总区采用的警政及训练策略。访问期间，水警总区指挥官吴卓衡与代表团举行高层会议，就广东海警局与水警总区的合作事宜签订协议。双方现可按照三层机制进行定期沟通、专题会议、情报与资讯交流及联合行动。

内地执法部门重组后，广东海警局于二零一九年成立一个直属分局，专责处理发生于香港特区上边界管理线外的执法事宜。多年来，水警总区与广东海警局依照香港警方与内地当局的边境联络机制，共同打击跨境非法活动。以二零二三年的非华裔人士偷渡潮为例，在广东海警局联同国家移民管理局、广东省公安厅及香港警方的跨境协作下，短短数月内成功遏止经海路偷渡的趋势。