为确保「粤车南下」顺利实施，交通总部联同运输及物流局、运输署、香港机场管理局、其他执法部门及相关警队单位进行一系列筹备工作，包括升级警务系统，以便读取和输入广东和澳门的车牌号码及司机资料，以及在案件管理及调查系统（CMIS）新增「粤车南下」案件类别作统计用途。

交通总部亦为警队高层管理人员和前线人员举办简报会。当中以十月二十四日举行的跨部门联合简报会反应最为热烈，参加人数超过200人，并有约500名人员观看P-TV直播。交通总部会继续向前线人员进行总区简报会，讲解相关安排。

为提升前线人员在处理「粤车南下」相关事件或案件的能力，运输及物流局和交通总部于九月和十月合办多场桌上和实战演练队单位，以测试各政府部门之间的沟通和协调能力。